公司長期堅持實施產品研發創新戰略，于成立之日起即設立研發中心，至今已有近20年歷史。公司建立了完善的研發體系，目前擁有研發人員400余人，博士占約25%、碩士占約70%，其中2人入選2012年“江蘇省333高層次人才計劃”。研發中心下設醫學部、注冊部、藥物化學部、中試基地、分析部、藥理部、制劑部、生物制藥部、質量部、知識產權與項目管理部、綜合管理部、人力資源部等內部機構。
公司的研發中心承擔國家“重大新藥創制”科技重大專項，國家高技術研究發展計劃，國家創新基金項目，國家重點新產品項目，國家火炬計劃項目等國家及省級重大科研項目20余項。我司研發中心具有國家認定的研究平臺4個：國家手性抗感染與靶向抗腫瘤等創新藥物的孵化基地、國家級博士后科研工作站、江蘇省工程技術研發中心、江蘇省企業技術中心。
在自主創新方面取得重大突破。目前公司已申請國內發明專利149個，其中已有24個提交國際PCT發明專利申請，授權專利國內49件，國外25件。迄今己獲新藥證書近百本，左旋奧硝唑及其制劑獲得國家一類創新藥證書及生產批件，該項目獲2010年科學技術部“國家重點新產品”、2012年首屆江蘇新醫藥十大創新項目、2014江蘇名牌產品等殊榮，并榮獲了2014年度江蘇省科學技術一等獎，其核心專利獲2015年“第十七屆中國專利優秀獎”。
2023年5月12日，公司自主研發的泛基因型慢性丙肝治療直接抗病毒藥物、化學1類創新藥圣諾迪?Sanoldi?奧磷布韋片獲批上市，并于2024年3月獲江蘇省創新藥械財政獎勵。
2024年，公司自主研發的化學1類創新藥品種圣瑞沙?甲磺酸瑞厄替尼片上市，圣瑞沙為第三代EGFR-TKI，用于治療存在EGFR T790M突變陽性（二線）和具有表皮生長因子受體（EGFR）外顯子19缺失或外顯子21（L858R）置換突變（一線）的局部晚期或轉移性非小細胞肺癌（NSCLC）成人患者。同時，注射用帕瑞昔布鈉、鹽酸莫西沙星片、維格列汀片、非那雄胺片、左奧硝唑片等產品已上市，為廣大患者帶來福音。
目前公司30余個新靶點的在研Ⅰ類創新藥項目，主要聚焦抗腫瘤和抗感染等領域，10余個Ⅰ類靶向創新藥已經完成臨床研究申報生產或即將完成臨床研究。
為進一步提高企業科技創新能力和生產能力，公司位于南京麒麟科技創新園的圣和總部及研發中心，歷時四年精心設計和建造，于2016年建成投入使用。同年11月，圣和藥業和中國藥科大學共同創立的“圣和藥業—中國藥科大學”聯合實驗室建成啟用。
預計到年底，研發中心的規模將繼續保持約400多人，對已涉及領域會有更深入的研究，必將讓更多的人享受健康的快樂。
（注：優諾安?左奧硝唑氯化鈉注射液 發明專利 專利號 ZL200510068478.9、發明專利 專利號 ZL200510083517.2、發明專利 專利號 ZL200510068419.1；圣諾迪?Sanoldi?奧磷布韋片 發明專利 專利號 ZL201410081865.5；圣瑞沙?甲磺酸瑞厄替尼片 發明專利 專利號ZL201711187449.3；圣可佳?賽博利塞膠囊 發明專利 專利號 ZL201610125706.X）
（麒麟總部研發中心大樓）